2025年度日本食品微生物学会技術セミナー 西日本（大阪）開催のご案内
以下のとおり、2025年度日本食品微生物学会主催技術セミナーを開催します。本セミナーは、遺伝子解読技術（いわゆる次世代シーケンサー、NGS）の活用と基本的なデータの取り扱いに関する知識の向上を目的として、講義と実習を行うものです。病原体をはじめとする微生物をNGSで解読したものの、データの扱いがわからない、そこから先どのように進めれば良いか相談したい、といった方を対象としています。なお、本セミナーでは細菌叢解析などのメタゲノムデータは取り扱いませんのでご注意ください。また、本講で主に扱うのはショートリードデータ（Illumina）となります。内容は昨年度とほぼ同じになりますので、合わせてご注意のほどお願いいたします。1日目の夜には情報交換会（参加者に追ってご連絡します）を行い、NGSを利用する上で皆さまが直面している課題、トラブルシューティングなどをより深く共有し、向上できる機会となるような場として企画しております。
皆さまのご参加をお待ちしております。
- 開催日程
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2025年11月8日（土）、9日（日）
8日 ： 13時00分～16時45分 9日 ： 9時30分～16時45分 - 研修会場
- 大阪公立大学 I-site なんば
〒556-0012 大阪市浪速区敷津東2-1-41 - 定員
- 15名（先着順、6月2日より学会HPで申し込み用のURLを公開します）
※Windows ノートPC（無線インターネット接続可能なもの）をご持参ください。(wifi環境はこちらでご用意します) - 主な講師
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野本 竜平（神戸市健康科学研究所 感染症部）
和田 崇之（大阪公立大学大学院 生活科学研究科） - 講義内容
- NGS解析の基礎知識、UNIXコマンドの基礎知識、リードデータの初歩的取り扱い、アセンブリ・マッピング解析の基本、他
- 実習内容
- コマンドラインの基礎、アセンブリ・マッピングの実践、分子系統樹の画出、他
- 参加費用
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正会員（本人に限る） ： ５,０００円 賛助会員（所属機関が推薦する2名まで） ： ５,０００円 一般（購読会員・非会員） ： １０,０００円 - 振込先
- 参加者の方に、追ってご連絡いたします。
- お問合せ・お申し込み
大阪公立大学 杉本キャンパス 和田 崇之
住所：〒558-8585 大阪市住吉区杉本3-3-138 生活科学研究科食栄養学科微生物学教室内
TEL：06-6605-2910
E-mail : twada@omu.ac.jp（お問い合わせはメールにてお願いします）- 予定スケジュール
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第1日
13:00-13:10 ： 開講の挨拶
日本食品微生物学会理事 大阪公立大学大学院教授 山崎伸二13:10-15:30 ： 講義 - NGS解析の基礎
- UNIXコマンドについての基礎知識
- 微生物のバイオインフォマティクス
15:30～ ： 実習 - Miniforgeを用いた汎用ツールのインストール
- fastqファイルのトリミング
- ゲノムアセンブリ
16:15-16:45 ： 4.質疑応答
大阪公立大学大学院教授 和田崇之
神戸市健康科学研究所感染症部副部長 野本竜平第2日
9:30-12:00 ： 講義 - SNP解析の基礎
- 細菌ゲノム配列を用いたSNP解析
- 系統樹作成・図示
12:00-13:00 ： 昼食 13:00-16:15 ： 実習 - 午前中の続き
16:15-16:45 ： 2.質疑応答
大阪公立大学大学院教授 和田崇之
神戸市健康科学研究所感染症部副部長 野本竜平